('除了改征营业税外，朱由检对商税的重大调整，那就是同样实行一税制。
大明的商税三十税一说起来并不高，但是仍有很多商人抱怨，那是什么原因呢？
除了一些商人不愿纳税的因素外，就是因为商人是会走动的，有可能在这边交了税那边还要交，被重复征收商税。
关税在财政中的百分之二占比，也是这样来的——
每过一个税关，都会被征一次税。
有权有势的大商人能用各种手段逃税，或者只缴纳三十税一的商税。
小商人可就不行了，有可能被重复征税数次，实际税负远超名义上的三十税一。
所以朱由检一再强调，对营业额一百元以下的个体户免税。对于营业税的征收，则按属地管理：
“营业税应该向注册地申报，每年二月到八月申报上一年度税务，向税务机构预约时间。”
“逾期由税务机构警告，并且征收滞纳金。当年未完成上一年度申报的，以偷税漏税处理。”
“平时税务人员不得骚扰企业，干扰企业经营。”
“具体的总公司、分公司，以及营业额主要在外地的公司税收如何算，太府寺摸索出方案来。”
太府寺卿董应举闻言领命，又听皇帝说道：
“内地税关要裁撤，以后只向出入边境的货物征税。”
“今后关税主要就是海关税，还有边疆的边关税。”
“境内往来流通，不再征收关税。”
“大明都要和藩属统一市场了，不能内部的市场还不统一。”
这种减税的事情，群臣大多是赞同的。
当年万历皇帝增加税关征税，没少受到他们抨击。
如今皇帝要裁撤内地的税关，他们怎么可能反对。
但是太府寺卿董应举却为难了，说道：
“关税占比虽少，到底也有二十多万。如果各地税关裁撤，赋税总额就低了。”
“还有海关和边关税收，是不是应该完全归太府寺？”
海关总署目前是户部和海军部共管，还要分一成给内库。
朱由检不想改变这个局面，反问道：
“没有海军和海警配合，户部能征收到多少海关税？”
“边关税也是同样，没有边防军配合怎么收？”
这下董应举无言以对了，朱由检继续说道：
“税务总署可以成立专门的边关署，和边防部一起负责征收边关税。”
“具体怎么分配，你们自己协商。边关税要加强征收、严查走私，配合边防政策，而且要全部用于边防和边疆建设，防止某些人为了税收不顾边疆安危。”
董应举对此无法反对，但是心下却无奈了。因为他知道这样太府寺就变成了给边防部打工的。无论名义上分到多少，最终都要拨到边疆地区。
这让他顿时丧失了和边防部争夺的动力，打算仿照海关总署的税收分配。
朱由检则在考虑重复征税的问题，认为在当前的条件下，完全避免重复征税是很难的事情，否则会出现大量偷税漏税。
为了减轻小民负担，他又继续下令道：
“个人用扁担或人力车贩运的货物，凡是在十石或一千斤、价值百元以内的，尤其是粮食、蔬菜、渔获等食物，一律不得征税。”
“各个城市还要留出专门的摊位给这些人，摊位费要尽量低。”
“被多征税或重复征税的企业和个人，可以保留税收凭据，在税务申报时申请退税。”
“太府寺要专门留出一部分税款，退还重复征收的部份。”
这无疑加大了太府寺的工作量，虽有很多大臣赞同，太府寺卿董应举却询问道：
“工商税是和地方分享的，朝廷这边退了，地方要不要退？”
“如果都退的话，事情太繁琐了，朝廷和地方都要增加很多官吏。”
朱由检眉头一皱，同样感觉棘手。因为现在是个完全靠人力的时代，太府寺现有的官吏根本不足以支撑如此复杂的退税。
毕自严出主意道：
“不如不退税款，而是开出税票。让被重复征税的税款，用于抵扣下一年度税务。”
“这样朝廷也不用专门留出资金给他们退税，有更多的钱能用。”
这个办法有的人赞同，有的人则提出质疑：
“这种税票被人伪造怎么办？那样岂不会偷税漏税？”
“有人拿着税票抵扣了，某地、某年的税收岂不大受影响？官员的政绩要怎么算？”
“还有官员故意重复征税，给后来者挖坑怎么办？”
这显然牵扯到很多问题，朱由检听着他们的讨论，总结道：
“抵扣税票这件事要慎重，最好是太府寺和地方衙门一起开，降低伪造可能。”
“或者向他们支付国库券，作为朝廷欠他们款项的证明。在国库有钱后再支付，并允许用国库券抵税。”
“至于官员考核的问题，可以把抵税单列，加强相关统计。对重复征税比例高的、抵扣数据异常的，都要严加审核，追究相应责任。”
这样无疑又增加了工作量，但是国库券这个说法，却让董应举眼前一亮，说道：
“国库券是国债吗？”
“就像东平伯国发行的债券？”
朱由检道：
“类似国债，但是利率更低甚至不给利息。”
“允许在证券交易所流通，券上标注使用年限，限期完成兑付。”
“如果急需用钱，还可以在银行抵押贷款。”
这显然比直接开具抵扣税票更好用，可以让急需用钱的人拿到钱，国库也有更多的腾挪时间。董应举道：
“臣以为发放国库券更可行，但需要太府寺和地方一起验证。”